打开文本图片集
Objective:Based on the network pharmacological method,to explore the mechanism of
Simiao Wan收集四妙丸中苍术、黄柏、牛膝、薏苡仁的化合物,并以口服生物利用度,选择研究物种为人类,设置靶点之间最低要求联系分数为0.4,并隐藏不与其他靶点联系的靶点,获得靶点联系网络图。将该图进一步导入Cytoscape 3.7.0软件进行拓扑学分析并构建PPI网络。
1.6 四妙丸治疗RA预测靶点富集分析 运用DAVID数据库,以P < 0.05作为筛选条件获得靶点蛋白进行基因本体和介数中心度、汉黄芩素,靶点前列腺素G/H合成酶2,转录因子AP-1,肿瘤坏死因子,说明它们在网络中起关键作用,是四妙丸治疗RA的主要有效化合物和靶点。
2.5 四妙丸对RA作用靶点的PPI网络构建结果 根据1.5中要求,STRING 10.5数据库获得14个靶点之间共81条联系的网络图。将图导入Cytoscape 3.6.1软件进行拓扑学分析得出联系其他靶点个数排名前6位的靶点依次是血管内皮生长因子A生物合成过程的正调节、钙调蛋白1-单加氧酶活性的正调节、发热的正调节、炎症反应、ERK1和ERK2级联的正调节等排位靠前;在细胞组成分析中,主要包括细胞外空间、细胞外区域、质膜外侧等;在分子功能分析中,包括细胞因子活性、生长因子活性、酶结合、内肽酶活性及金属内肽酶活性。KEGG通路富集分析显示共35条通路,取前20条通路制作KEGG高级气泡图见图5,结果显示,四妙丸治疗RA的机制中TNF信号通路被显著性富集。其中四妙丸作用于TNF通路排名靠前的化合物为槲皮素和汉黄芩素,见表1。与TNF信号通路相关的靶点有9个,分别是VCAM-1、IL-6、TNF、CCL-2、PTGS-2、JUN、IL-1B、MMP-3、SELE,其中PTGS2。节点度和介数中心度数值较高,是TNF通路中的关键靶点。此外,JUN和TNF也是该通路的主要靶点,与RA发生的机制密切相关。见表2。
3 讨 论
RA是一种以关节滑膜炎症为主要病理表现的慢性自身免疫性疾病。本研究发现,槲皮素及汉黄芩素是四妙丸至关重要的有效化合物,TNF、IL-6、VEGFA、PTGS2、JUN是四妙丸治疗RA的关键靶点。有研究表明,100,200,400 mg·kg-1的槲皮素灌胃能明显减轻急性痛风性关节炎大鼠的关节炎症反应,且对肝功能无损害.Chin Pharmacol Bull,2006,22(11):1291-1296.
收稿日期:2019-03-24;修回日期:2019-05-08
查看全文
false