就像书名一样，这是一个发生在杂货店的故事。讲述了一些人的忧虑和店铺如何解答。作者并没有用一问一答那样单调手法！本书一共分为5章，每一章分别是引出一个主人公和他的忧虑！
第一章讲述了，解忧杂货铺引来的第一个烦恼！解答人：幸平、翔太、郭也三个年轻人；提问者笔名：月兔！
因为入室抢劫，找地方藏身等待天亮，三个年轻小伙躲到了一个名叫“浪矢杂货店”的地方！在店内藏身的时候，意外收到了来自的月兔的咨询信！很快他们发现这个杂货店室内和屋外的时间不同步！在2次交流后，发现月兔时生活在1980年代左右的击剑手。她的烦恼是：自己即将订婚的男朋友身患绝症，将不久于人世，自己几个月后却要参加奥运会！把时间花在集中训练上？还是陪男朋友度过剩下的几个月！月兔自己内心因为训练遇到了瓶颈，正好男友生病，所有产生了想要放弃训练的想法！自己的男友却怕自己成为月兔的拖累，坚持让月兔去训练，不让她放弃！于是她将自己的烦恼写信投进了杂货店的信箱。因为种种原因，在过去投递的信件，会传到现代翔太等人的手中，而现代投递的信件，又会传到过去店主雄治的手中！翔太等人用手机查那个年代发生的事情，发现1980年日本抵制了那届奥运会，所以建议月兔放弃训练陪在男友身边！但月兔并不知道对方为何会如此坚定的给出答案！以为这是对方故意这样讲考验自己的梦想！可能人就是这样，越不让你干什么，反而会激发自己的斗志！最后月兔采取的行动是：和男朋友讲明实情！表明了参加奥运会是自己的梦想，陪在身边也不能更好的照顾男友，所以会带着他两共同的目标，全力以赴地训练！男友知道更是欣然的同意，更感谢她为自己圆梦！
第二章写的是一个叫克郎的男子，因为喜欢音乐，在读东京大学一年级的时候，就辍学了，当时父母极力的劝阻！经过几年的打拼之后，在一家不知名的小店里面演出。他的父母时候开了一家祖传的鱼松店。父亲因为克郎奶奶去世以及日常的操劳住院了！他的烦恼是：继承祖传的店还是完成自己音乐梦想？矛盾的他也将自己的烦恼写信咨询杂货铺！开始翔太等人起初回信让他继承家人的小店，不要做音乐的白日梦！但是执着的克朗认为杂货铺的人是因为不了解自己的水平，所以才轻率的让自己放弃梦想！于是他将信在投入卷帘门的递信口时，拿口琴吹起了自己最拿手的曲子！优美的曲子跨越了时空，飘进了屋内，翔太等人一听是一首脍炙人口的歌！而这首歌却是另外一个女人的成名曲，她反复演唱的初衷是感恩用生命救了她弟弟的人！屋内的小伙们顿时明白这个人的结局了！想着克郎的执着，还是建议他继续追寻自己的音乐梦！他的父亲也表达了让克郎努力拼出一片天地的心情。他收拾行囊出发了，继续自己的音乐。几年后为丸光园的幼儿园小朋友演奏那天，他遇到了叫水原芹的小姑娘，很喜欢他演奏的“重生”。晚上幼儿园发生了火灾，克郎返回救小姑娘的弟弟，被大火烧伤，最后死于医院！就像翔太他们知道的那样，最后水原芹长大后成为一名女歌手，反复演唱那首叫做《重生》的歌曲！本章用了倒叙的手法，先写了克郎去幼儿园的事情，再通过水原芹的追问为何不成为职业音乐人，来追忆！从这可以看出、全书不仅是倒叙，而且每个小故事、也是采用的倒叙手法！开始看第二章节的时候，会以为本书是一个个小故事。直到克朗和月兔在杂货店门口的偶然相遇，才发现、这故事是个整体！
第三个故事开始写店主雄治的故事了。雄治的儿子叫贵之，在东京一家公司上班。偶尔来店里看看，母亲10年前因心脏并离世！父亲已80，所以怕他一个人生活不便，想邀请他和自己一起去东京住，但是雄治因为给人提供咨询解答，享受到了快乐，便谢绝了！这天贵之又来看望雄治，雄治收到一个名叫绿河的女人来信，她怀上了一个有妇之夫的的孩子，预料未来这个男人很可能会不负责任，但是考虑到自己不能再生育了，也想把小孩生下来，所以写信来问问雄治的意见！雄治给了回信是：雄治给母亲的建议：无论是单亲还是双亲，只要能给孩子幸福，都是好的！2年后的雄治病倒了，决定关掉浪矢杂货店。贵之追问原因才得知，父亲前几个月看到报纸上写了篇新闻，一个女子携孩子开车坠海自杀，开车女子死亡，孩子活了下来！雄治怀疑是2年前写信给他的女子！因为接受了自己的意见，最终过上了不好的生活！他开始焦虑怀疑审视之前给别人做的决定是否正确了！于是决定关闭小屋不再给人咨询意见，搬去和儿子住在一起。没多久就查出是胃癌晚期。病后的雄治给了贵之一份异样的遗嘱，让贵之在自己死后33年，发表声明，让之前咨询过自己问题的人，发来回信！九月十三日晚，咨询信箱将复活！病中的雄治让他带自己回到杂货店，当晚没多久，就收到了各种寄来的感谢信！其中一封就是绿河的女儿，她告诉雄治：她母亲死后自己被送进了丸光园，起初非常恨自己的妈妈，她要带着自己去死，知道后曾试图自杀。孤儿院听说过我身世的水原芹告诉了自己真相。当时母亲开车坠海是属于事故，出事时，母亲的体重只有30公斤，在这样的情况下，自己却被母亲照顾的很健康。她的遗物中有一封很珍惜的信件，是雄治给母亲的建议。自己现在成为了水原芹的经纪人，过上了相对不错的生活，表达了对雄治的感谢。雄治也因为看到了这些好的回馈、得到了欣慰，过上了安稳生活，一年安详的死去了。
第四个故事的主人公叫浩介。受表哥的影响喜欢上了披头士的音乐！因为家人给浩介提供了比较好的生活，所以买了很多披头士的胶片，家里也有很好的音响，时常邀请伙伴们来家里听音乐！乐队的音乐和一举一动，是浩介精神的食粮。有一天，家里的经济好像忽然变差了，父母取消了浩介的世博会游玩。并告诉他，因为某种原因，某天晚上要搬离现在的家，开始流亡生活。与此同时，披头士乐队也传来了解散的消息。双重打击下浩介将自己的烦恼写信咨询雄治，这也是雄治当时收到的第一封正式的烦恼来信。雄治告诉浩介，无论遇到什么问题，应该和家人待在一起，如果意见不一致，等待改天再找机会一起慢慢解决！浩介开始也同意雄治的建议，慢慢接受了事实！因为要逃亡，父母偷偷卖掉了浩介的影响设备。浩介的内心还是抵触四处流亡的生活。在临行前，浩介将自己的胶片卖给了小伙伴。在逃跑的途中，父亲很严厉的说因为浩介卖胶片手里有点钱，未来几个月将不再给生活费！趁着上厕所回车上的路上，他偷偷的爬上了别人的卡车，决定不再和父母一起逃亡。因为不肯开口说父母的姓名和家庭住址，几经周折，警察把浩介安排在了丸光园孤儿院。害怕与人多交流泄露自己的身世，浩介沉默寡言，学会了雕刻东西。他时常雕刻一些小玩意送给别的小朋友，其中一个名叫晴美。浩介雕刻了一只小狗给她，因为在孤儿院玩具的匮乏，浩介和小狗玩具给晴美的童年留下了美好的回忆(这也为引出第五章的主人公埋下伏笔。因为喜欢雕刻，浩介最后跟了个雕刻师傅学习手艺，过上了不错的生活！有天看到网上刊登了，说浪矢杂货店的咨询窗口将激活，于是当晚来到了浪矢小店。找到镇上一家酒店写信，等待凌晨时刻投信。店铺女老板放着披头士的音乐，浩介仔细看了胶片，才发现、这是自己卖给朋友的！问了才知道，胶片果然是儿时卖出的那些。从女老板的口中得知了、父母后来的事情：大家都说，父亲把儿子和母亲用船，沉入了海底；父亲上吊自杀，留下了遗书，说明了自己杀死妻儿的事情。浩介此时才明白，父母为了不让追债的人找上自己，伪造了自己死亡的假象，这么多年自己安稳的生活不仅来自己的努力，也是父母用生命换来的。本来浩介想回信说，自己没有听取雄治的建议，过上现在的美好生活靠的是自己，但听完酒店老板的讲述，才知道事实并非如此。于是浩介更改了自己的回信，信上感谢雄治的建议，并说现在和父母生活在一起，一家人共同努力度过了难关！
第五个故事的主人公是晴美。晴美在外婆死后，和姨婆生活在一起。姨婆女儿搬回来的那段时间，晴美在丸光园生活了一段时间。姨婆女儿搬走后、又回来和姨婆一起生活。长大后为了报答姨婆，减缓生活的压力，想快速赚钱，晴美白天上班、晚上在会所陪酒。会所的陪酒收入更快也更多，但是怕被人知道后诟病，所以写信咨询。这次解答人是翔平等人。翔平知道日本后来的经济发展得益于房地产、股票、互联网，于是建议晴美不要长久做陪酒，学习股票、地产知识，利用做陪酒赚的钱、去炒房！这些惊世骇俗的内容，翔平等人也不知道晴美会不会相信并执行，因为一直没能等到她的回复！开始半信半疑的晴美认为翔平等人没有害自己的必要，开始抱着试试看的心情，没想到在之后的10年里，果然迎来大的发展，最后开了自己的公司！看到电视上放丸光园遭遇了火灾，回去帮忙的时候遇到了儿时的伙伴浩介，这又再次将故事四串起！聊天的过程中，晴美告诉了浩介自己的现在得益于当初浪矢小店的建议！这也是浩介长大后前去浪矢小店的原因之一。晴美去幼儿园送救灾物资的时候，院长讲述了自己姐姐开办幼儿园的故事！院长的姐姐在年轻时（约1930年左右）和一个叫浪矢的人（就是杂货店主雄治）私下恋爱并准备私奔，结果被家里仆人告发，没能走成！3年后浪矢又写信给院长姐姐，对当时的鲁莽行为道歉，她家人的行为是正确的，并说自己过得很好。最后，院长姐姐终身未嫁。写到这里会忽然发现，这还是个爱情故事！雄治解答的疑惑都来自于丸光园；而丸光园又是院长姐姐开的，他们形式上没有在一起，却又因为冥冥注定，千丝万缕。院长不久也死了，他儿子将孤儿院托给另外一人管理，这人不善于管理，幼儿园眼看就要倒闭，此时晴美准备出手收购！翔平等人自小也是从孤儿院长大，道听途说得知有人（这是还不知道写信的人就是晴美，因为用的是笔名）要收购幼儿园开情侣旅社，再加上平时也干些小偷小摸的事情，所以起了歹念想去晴美家里抢劫。没想到正巧遇到回来准备去投感谢信的晴美。打劫后这几人就躲到了浪矢杂货店，就回到了文章的开头！在翻打劫来的晴美的包时，翔平等人看见了晴美写的感谢信。信上感谢浪矢杂货店的建议，自己执行并赚到了钱。最近准备收购一家叫丸光园的幼儿园，想买来自己管理，报答社会。此时翔平等人不仅知道了自己的建议帮助到了别人，此人也正是晴美本人；同时知道了晴美收购幼儿园的真实目的。书的结尾处，翔平等人准备回去解开绑住了的晴美，然后警察局自首、重新开始生活。
整书是围绕杂货店和丸光园展开的。从雄治的解答、处事方式看出他应该是个温暖、负责、幽默、有智慧的人！他的智慧感化了很多人，他的付出、作者也是肯定的，给他安排了很好的结局。形式上看2人并没有在一起、但是他们通过更宏大的爱、又交集在一起。作者或许通过解忧杂货店的问答形式、对社会问题给出了自己的思考：爱情和梦想之间的选择：爱情应该为梦想助力！梦想和现实的选择：有梦想就去追、没死就别停！家庭矛盾的处理方法：家人在一起最重要，有问题、不要怕，慢慢想解决的办法！什么是真爱一个人：希望她过的更好！不能给她幸福、也至少不因为自己而苦恼！赚快钱走、捷径和努力踏实工作：机会总是很多的，努力花时间、下功夫，你的成就会使自己幸福，也会让身边人过的更好！作者给出的答案，在小说里“必然是正确”的！因为他以穿越的形式、描述了历史；通过反馈信的形式、雄治知道自己给出的答案是正确的！但生活中、这些问题未必是唯一的，或许会有更优的处理方法。所以全书的题材是小说、而不是生活事故处理手册！小说更多是启发式的、假象的，可即便是这样、我们有同样问题的人、作者给出的答案、是不是也值得借鉴呢？
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