首先，存在问题
(a)职能重叠
纪委监察科对责任部门(单位)履行纪检监察职能，纪委作为9个有党委的市级部门(单位)，也对本单位履行纪检监察职能，形成事实上的重叠关系。在教育、监督等工作中，特别是信访调查、案件预审、案件调查和案件审理中，要进一步划分职能，明确责任，规范程序，理顺关系。
(2)机构设置不匹配
在对派出机构进行统一管理的过程中，保留纪委的9个市直单位中，有3个被收回了督察室，另外6个市直单位除了履行督察职能的公安局外，没有设立自己的督察室。导致只有检查机关，没有监督机构，纪检监察两个机构不匹配，削弱了行政监督职能，影响了监督工作的正常开展。
(三)人员配备不足
9个市直单位的纪委人员编制中，除公安局纪委外，其他8个部门(单位)只有纪委书记一职，无工作人员，纪委书记还负责其他业务工作。由于人员不足，无法独立工作。在案件调查、监督检查中，很难通过组织协调其他人员来保证纪检监察工作的顺利开展。但需要增设纪委副书记、纪委主任等岗位，受人员编制限制，导致市直单位纪委无法正常开展纪检监察工作。
(四)自身建设滞后
中央纪委等五部委下发9号、10号文件后，地方县级纪检监察机关建设全面加强。一方面，市直单位纪委处于人员短缺的困境，另一方面，承担着繁重的反腐任务，成为被忽视的领域。人员配备、干部配备、办公设备、经费保障等问题更加突出。
二、工作建议
随着反腐倡廉建设的深入，特别是按照中央“坚决惩治腐败，更加注重预防、治本和制度建设”的要求，直属部门(单位)纪委预防腐败的任务更加繁重，发挥职能的空间和领域更加广阔。重视和支持直属部门(单位)纪委自身建设意义重大。针对直属部门(单位)自身建设中存在的问题，提出以下工作建议:
(1)加强市级部门(单位)纪检监察机构建设
派出直属纪检监察机构后，要进一步加强部门(单位)内部监督，加强内部纪检监察机构建设。设立党委的部门(单位)在保留纪委的同时，要研究解决岗位设置和人员配备问题。干部100人以上或党员80人以上的部门(单位)应有一个督查室和一名督查室主任；增加纪律委员会副书记、纪律委员会办公室主任；干部不足100人或党员不足80人的综合部门(单位)应配备专职纪检监察人员，保证有2-3名专职纪检监察干部。没有内置的纪检监察机构，但涉及人权、权力、财权的重点部门(单位)要明确一个领导负责反腐倡廉建设，并设立纪检监察联络员负责开展具体业务工作，同时接受纪委监察科派出的业务指导。
(二)明确划分市纪委部门(单位)和派出纪委监察分局的职责权限
明确市级部门(单位)纪委全面负责本部门(单位)的纪检监察工作，接受纪委监察科的领导和指导。市级部门(单位)纪委原则上负责部门级以下干部的信访、初审、调查和案件审理，如需纪委支持配合，应向主管(联系)纪委提出；对“三大一大”决策的监督，以及领导小组及其成员的监督，由市部门(单位)纪委和市纪委共同负责。如涉及需要初核调查、调查的，由市纪委负责，市级部门(单位)纪委配合。
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